序列比对/序列对齐：一种把两条或多条生物序列（如 DNA、RNA 或蛋白质序列）按相应位置“对齐”的方法，通过允许插入空位（gap）来最大化相似性，从而推断它们的相似关系、同源性或功能/进化关联。（在计算机科学里也可指一般“序列”的对齐，但最常见用法在生物信息学。）
/ˈsiːkwəns əˈlaɪnmənt/
We used sequence alignment to compare two DNA samples.
我们用序列比对来比较两份 DNA 样本。
After performing sequence alignment with a scoring matrix and gap penalties, the researchers inferred an evolutionary relationship among the proteins.
研究人员使用评分矩阵和空位惩罚进行序列比对后，推断这些蛋白质之间存在进化关系。
sequence 源自拉丁语 sequentia（“连续、顺序”），强调“按顺序排列的一串元素”；alignment 来自 align（使成一线、对齐），原义与把物体排成直线有关。合在一起，sequence alignment 字面意思就是“把序列对齐”，后来在生物信息学中固定指“通过算法把生物序列匹配到最佳对应位置”的方法。
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